涉及序列的發(fā)明專利申請如何既擴(kuò)大保護(hù)范圍又能得到說明書支持?附案例
專利代理 咨詢電話 18210958705 QQ 2101183472 發(fā)布時(shí)間:2021-03-13 23:35:00

生物領(lǐng)域中,涉及氨基酸或者核苷酸序列的發(fā)明專利申請,其序列的可替換形式非常豐富。以蛋白序列為例,蛋白分子序列總長為100個(gè)氨基酸,每個(gè)位點(diǎn)又20種氨基酸替換形式,如果每個(gè)位點(diǎn)都可變的話,理論上該蛋白的序列變化數(shù)量為20100種;如果只有一個(gè)位點(diǎn)可變(也就是同源性99%),但不限定具體位置和突變形式的話,也有2000種。另外,雖然一級(jí)結(jié)構(gòu)決定了高級(jí)結(jié)構(gòu)和功能,但從一級(jí)結(jié)構(gòu)本身確無法推定其功能,而且序列同一性的高低也與蛋白分子的功能無必然聯(lián)系。有時(shí)候,功能域中重要位點(diǎn)的一個(gè)突變就會(huì)導(dǎo)致蛋白喪失其功能,相反,某些位點(diǎn)的多個(gè)突變可能不會(huì)影響蛋白功能或無顯著影響。
正是因?yàn)樯镄蛄械淖儞Q形式存在高度的可變性,申請人不可能對所有可變形式都進(jìn)行驗(yàn)證,但僅保護(hù)經(jīng)過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的具體序列,又會(huì)造成保護(hù)范圍過窄,他人很容易規(guī)避權(quán)利要求的保護(hù)范圍。所以通常申請人在撰寫權(quán)利要求書時(shí),都會(huì)想辦法盡量擴(kuò)大保護(hù)范圍,可是生物分子功能又難以預(yù)測,就導(dǎo)致生物領(lǐng)域中得不到說明書支持的問題大量出現(xiàn)。如何避免呢?
實(shí)際上,專利局對于生物序列類的專利審查標(biāo)準(zhǔn)并非嚴(yán)格到權(quán)利要求只允許保護(hù)實(shí)施例,其對序列是否得到說明書支持的審查仍然是遵循著各領(lǐng)域共同的總體思路進(jìn)行的,即:綜合考慮發(fā)明專利申請文件記載的信息、發(fā)明的改進(jìn)之處、現(xiàn)有技術(shù)的整體情況、發(fā)明所屬技術(shù)領(lǐng)域的可預(yù)測性、所屬技術(shù)領(lǐng)域的技術(shù)人員的知識(shí)和能力、權(quán)利要求的保護(hù)范圍等進(jìn)行綜合判斷。
因此,申請人應(yīng)對發(fā)明點(diǎn)有準(zhǔn)確的把握,能夠在說明書中記載現(xiàn)有技術(shù)狀況,必要時(shí)提供現(xiàn)有技術(shù)證據(jù);從發(fā)明點(diǎn)出發(fā),記載足量而有代表性的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù);對權(quán)利要求進(jìn)行適當(dāng)?shù)摹⒂袑哟蔚母爬ǎ员惬@得與發(fā)明的貢獻(xiàn)相適應(yīng)的保護(hù)。
下面列舉一些在實(shí)施例基礎(chǔ)上概括適當(dāng)而最終既爭取到較大保護(hù)范圍又滿足得到說明書支持要求最終獲得授權(quán)的案例。
案例1、發(fā)明點(diǎn)以及現(xiàn)有技術(shù)證據(jù)在支持問題中的作用
1.鳥苷酸環(huán)化酶B活化劑用于制備關(guān)節(jié)炎的治療劑或預(yù)防劑的應(yīng) 用,
其中所述的鳥苷酸環(huán)化酶B活化劑為C型利鈉利尿肽或其衍生 物,
其中所述的C型利鈉利尿肽選自SEQ ID NO:1的CNP-22和SEQ ID NO:2的CNP-53,和
其中所述的衍生物選自具有在SEQ ID NO:1的氨基酸序列中的1 到5個(gè)氨基酸的缺失、置換或附加并具有活化鳥苷酸環(huán)化酶B的活性 的鳥苷酸環(huán)化酶B活化肽和具有在SEQ ID NO:2的氨基酸序列中的1到5個(gè)氨基酸的缺失、置換或附加并具有活化鳥苷酸環(huán)化酶B活性的 鳥苷酸環(huán)化酶B活化肽。
說明書背景技術(shù)中記載,SEQ ID NO:1是SEQ ID NO:2的一部分,兩者通過分子間二硫鍵形成環(huán)狀肽結(jié)構(gòu)的相應(yīng)位置基本相同,都屬于現(xiàn)有技術(shù)已知的GC-B活性劑CNP。現(xiàn)有技術(shù)中還存在其他類似的CNP肽。該申請對現(xiàn)有技術(shù)的主要貢獻(xiàn)在于發(fā)現(xiàn)GC-B活性劑CNP具有抗關(guān)節(jié)炎作用以及對關(guān)節(jié)軟骨的同化作用。
說明書實(shí)施例中對具有SEQ ID NO:1序列的CNP-22進(jìn)行了一系列實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,CNP-22具有抑制關(guān)節(jié)炎的作用,與NSAID聯(lián)合還具有協(xié)同作用。但是說明書中沒有對SEQ ID NO:1缺失、置換或附加的衍生物進(jìn)行任何實(shí)驗(yàn)。
基于此,審查員駁回了關(guān)于缺失、置換或附加這一保護(hù)范圍的專利權(quán)請求。
申請人提出復(fù)審。
復(fù)審?fù)ㄖ獣校才c駁回決定一樣,指出了“用1 到5個(gè)氨基酸的缺失、置換或附加”來限定衍生物得不到說明書支持。
附申請請求人在答復(fù)復(fù)審?fù)ㄖ獣鴷r(shí),提交了優(yōu)先權(quán)日之前公開的附件1,其中詳細(xì)記載了保持CNP的GC-B活性劑活性的結(jié)構(gòu)要求。專利復(fù)審委員會(huì)在此基礎(chǔ)上撤銷了駁回決定。
復(fù)審決定中認(rèn)為,附件1已經(jīng)通過具體的氨基酸取代、缺失和添加證明了通過氨基酸取代、缺失和/或添加得到的多個(gè)CNP-22變體仍具有與原始序列相類似的活性,多個(gè)變體的數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合后的結(jié)果也清楚明確地揭示了CNP-22的功能結(jié)構(gòu)域。本領(lǐng)域技術(shù)人員在結(jié)合附件1所公開的內(nèi)容的基礎(chǔ)上能夠很容易地確認(rèn)對所述CNP-22肽的哪些位點(diǎn)能夠進(jìn)行相應(yīng)的取代、缺失和/或添加不會(huì)明顯影響肽活性,并結(jié)合該發(fā)明已經(jīng)確認(rèn)的CNP-22能夠治療關(guān)節(jié)炎的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)預(yù)期這些與CNP-22具有類似活性的變體也能夠?qū)崿F(xiàn)該發(fā)明治療骨關(guān)節(jié)炎的目的。雖然說明書中未對CNP-22相應(yīng)的變體進(jìn)行活性或效果實(shí)驗(yàn),但本領(lǐng)域技術(shù)人員在本申請公開的內(nèi)容的基礎(chǔ)上,結(jié)合附件1公開的內(nèi)容能夠通過在SEQ ID NO:1的氨基酸序列中的1到5個(gè)氨基酸的缺失、置換或附加很容易制備得到具有活化鳥苷酸環(huán)化酶B的活性的CNP-22變體,并預(yù)期所述變體將具有與CNP-22類似的活性。此外,基于CNP-22與CNP-53結(jié)構(gòu)序列上的相似性,本領(lǐng)域技術(shù)人員在本申請公開的內(nèi)容的基礎(chǔ)上結(jié)合現(xiàn)有技術(shù)應(yīng)該也能夠預(yù)期CNP-53能治療骨關(guān)節(jié)炎,并在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步預(yù)期對CNP-53進(jìn)行1到5個(gè)氨基酸的缺失、置換或附加得到的變體也將具有與CNP-22相似的治療骨關(guān)節(jié)炎的活性。因此權(quán)利要求1能夠得到說明書的支持。
小結(jié):
該案中,權(quán)利要求保護(hù)的是一種多肽的新用途發(fā)明,并且對多肽的衍生物進(jìn)行了概括。可見,其改進(jìn)之處不在于多肽本身,而是它的新用途。
一般而言,與發(fā)明相對于現(xiàn)有技術(shù)改進(jìn)之處不在于不相關(guān)或關(guān)聯(lián)性不大的技術(shù)特征,通常屬于現(xiàn)有技術(shù)范疇,所屬技術(shù)領(lǐng)域的技術(shù)人員容易知曉其替代方式并預(yù)見其技術(shù)效果;相反,對于那些與發(fā)明改進(jìn)之處密切相關(guān)的技術(shù)特征,所屬技術(shù)領(lǐng)域的技術(shù)人員很難預(yù)見其替代方式,如果說明書中針對該技術(shù)特征的公開不能達(dá)到使所屬技術(shù)領(lǐng)域的技術(shù)人員能夠概括得出并預(yù)期到其相應(yīng)的技術(shù)效果的程度,則權(quán)利要求得不到說明書支持。
案例2、實(shí)施例數(shù)量及其代表性的關(guān)鍵作用
1.一種分離的變體α-淀粉酶,其在三個(gè)或更多個(gè)位置上的取代選自于V59A,Q89R, G112D,E129V,D165N,W166F,E168A,K171E,K177L,R179E,A184S,H208Y,K220P,N224L, S242Q,Q254S,D269E,I270L,H274K,Y276F,D281N,M284V,G416V,L427M,其中親本α-淀粉酶由SEQ ID NO:6的氨基酸序列組成,所述變體與親本α-淀粉酶具有至少98%且小于100%的序列同一性,并且該變體具有α-淀粉酶活性,而且所述變體含有下述取代:E129V+K177L+ R179E。
說明書中記載,本發(fā)明提供與親本酶相比具有改善性質(zhì)的α-淀粉酶變體,例如改善的熱穩(wěn)定性。說明書實(shí)施例中測定了親本酶(SEQ ID NO:6)和其45種變體在不同溫度、pH值下變體的半壽期。45種變體相對于親本酶在權(quán)利要求1中限定的位點(diǎn)發(fā)生1至10個(gè)位點(diǎn)的突變。
該案在審查階段被駁回,申請人提出的復(fù)審請求。
“駁回決定”和“復(fù)審?fù)ㄖ獣?rdquo;認(rèn)為,權(quán)利要求1中采用“包含”的開放式限定,其中除了權(quán)利要求1中所限定的位點(diǎn)之外,還可以包括SEQ ID NO:6上的其他任意位點(diǎn)的取代,而包含的未具體限定的位點(diǎn)是無法確定的,氨基酸序列中一個(gè)氨基酸發(fā)生變化,也可能會(huì)破壞整個(gè)蛋白質(zhì)分子的空間結(jié)構(gòu),進(jìn)而影響其功能活性。因此,權(quán)利要求1用開放式限定的技術(shù)方案得不到說明書的支持;其次,權(quán)利要求1中沒有限定取代前后的氨基酸種類,即所述位點(diǎn)的氨基酸可以被其他任意種類的氨基酸所取代,說明書實(shí)施例1的表1中所列舉的取代組合,其中的氨基酸基本是被固定的氨基酸所取代,沒有證據(jù)表明在所述位點(diǎn)的任意氨基酸的取代都可以保持α-淀粉酶的活性并獲得熱穩(wěn)定性提高的功能,因此權(quán)利要求1限定的技術(shù)方案得不到說明書的支持。
復(fù)審請求人在答復(fù)“復(fù)審?fù)ㄖ獣?rdquo;時(shí)修改的權(quán)利要求1內(nèi)容如下:
1. 一種分離的變體α-淀粉酶,其在三個(gè)或更多個(gè)(數(shù)個(gè))位置上的取代選自于V59A,Q89R,G112D,E129V,D165N,W166F,E168A,K171E,K177L,R179E,A184S,H208Y,K220P,N224L,S242Q,Q254S,D269E,I270L,H274K,Y276F,D281N,M284V,G416V,L427M,其中親本α-淀粉酶由SEQ ID NO:6的氨基酸序列組成,所述變體與親本α-淀粉酶具有至少98%且小于100%的序列同一性,并且該變體具有α-淀粉酶活性,而且所述變體含有下述取代:E129V+K177L+R179E。
專利復(fù)審委員會(huì)認(rèn)為,修改后的權(quán)利要求1采用了封閉式撰寫,所限定的變體僅限于其所列有限位點(diǎn)發(fā)生取代突變的變體,并且,取代后的氨基酸也做了具體的限定。雖然其中還采用同一性的方式撰寫,但變體與親本序列也僅限于所列的取代突變類型,并且親本SEQ ID NO:6為491個(gè)氨基酸組成的序列,其98%的同一性意味著最多可變的氨基酸數(shù)量為10個(gè)。說明書實(shí)施例中所列舉的變體已經(jīng)證明了至少98%同一性的、具有權(quán)利要求1中限定的具體位點(diǎn)的氨基酸取代可以達(dá)到本申請的發(fā)明目的,提供與親本酶相比具有改善性質(zhì)的α-淀粉酶變體,例如改善的熱穩(wěn)定性。因而,權(quán)利要求1已限定能夠合理預(yù)期提高α-淀粉酶性能的突變,從而權(quán)利要求1所概括的范圍是本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠從說明書充分公開的內(nèi)容中得到或者概括得出的,因此,權(quán)利要求1得到了說明書的支持。
小結(jié):
該案例的發(fā)明點(diǎn)在于對現(xiàn)有生物分子進(jìn)行改造,以取得更好的熱穩(wěn)定性,這依賴于序列中突變位點(diǎn)和突變氨基酸類型的具體選擇。所以要使權(quán)利要求得到說明書的支持,對于權(quán)利要求的撰寫以及說明書實(shí)施例的要求都是非常高的。該申請的優(yōu)勢在于,說明書中提供了大量的實(shí)施例,以證明其在哪些位點(diǎn)進(jìn)行何種類型的氨基酸突變能夠提高熱穩(wěn)定性。因此,在權(quán)利要求修改后,該申請還是能夠獲得一個(gè)適當(dāng)概括的保護(hù)范圍,而非具體實(shí)施例。
(孫敏編輯,部分內(nèi)容出自“生物領(lǐng)域中序列支持問題的若干典型案例分析”,作者韓世煒,國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局專利復(fù)審委員會(huì))
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